AIKraft/Skills/genomic-intelligence

genomic-intelligence

Предсказывает регуляторные признаки, структуру генов и экспрессию по ДНК-последовательности через REST API и MCP-сервер Genomic Intelligence. Полезно при наличии гена, региона или FASTA для анализа промоторов, сплайсинга, энхансеров и аннотации.

KDK-Dense official Данные ★ 47.8k

Что делает навык

Genomic Intelligence предоставляет доступ к трансформерным моделям ДНК через REST API и MCP-сервер для анализа последовательностей. Skill предсказывает регуляторные признаки, такие как промоторы, сайты сплайсинга, активность энхансеров, хроматиновое состояние, экспрессию (log TPM) и аннотацию de-novo генов.

Когда применять

  • Анализ промоторных регионов и сайтов сплайсинга по заданной ДНК-последовательности
  • Оценка активности энхансеров и хроматинового состояния геномных участков
  • Предсказание уровня экспрессии генов (log TPM) на основе последовательности
  • De-novo аннотация генов и поиск новых генов в предоставленных данных

Как работает

  1. Получить от пользователя входные данные: символ гена, геномный регион или ДНК/FASTA-последовательность
  2. Отправить запрос к хостинговому API (REST или MCP) genomicintelligence.ai
  3. Получить структурированные предсказания от трансформерных моделей, работающих на управляемых GPU
  4. Вернуть пользователю результаты анализа (промоторы, сплайсинг, энхансеры, экспрессия и т.д.)

Примеры запросов агенту

Проанализируй этот FASTA-фрагмент на наличие промоторов и сайтов сплайсинга через Genomic Intelligence
Предскажи экспрессию (log TPM) и хроматиновое состояние для гена TP53 с помощью GI
Выполни de-novo аннотацию генов в предоставленной геномной области через API Genomic Intelligence

Что понадобится

  • Доступ к интернету для обращения к REST API (api.genomicintelligence.ai) или MCP-серверу (mcp.genomicintelligence.ai)
  • Отсутствие необходимости в локальном запуске моделей, GPU или Python-стеке (thin client)

Описание составлено по SKILL.md навыка, сверено 08.10.2026.

Как подключить

1Скачать навык
# возьмите папку навыка «genomic-intelligence» из репозитория: # https://github.com/k-dense-ai/scientific-agent-skills
2Положить папку с SKILL.md к навыкам ассистента
# положите папку навыка туда, где ассистент ищет skills: cp -r genomic-intelligence/ ~/.claude/skills/genomic-intelligence/

Навык — папка с файлом SKILL.md (описание + инструкции) и опциональными скриптами. Ассистент (Claude, Claude Code и совместимые) подхватывает его по описанию и следует шагам.