AIKraft/AI/Войти
AIKraft/Skills/tooluniverse-phylogenetics

tooluniverse-phylogenetics

Филогенетический анализ — de novo множественное выравнивание последовательностей (Clustal Omega/MUSCLE/MAFFT через EBI_msa_align) и построение деревьев методом соседнего соединения/UPGMA (EBI_build_phylogenetic_tree) на основе ваших собственных последовательностей, а также анализ деревьев, оценка древовидности, насыщения (PhyKIT), информативных для парсимонии сайтов, анализ пробелов в выравнивании, DVMC, обнаружение длинных ветвей, ортологи BUSCO. Использует PhyKIT, Biopython, DendroPy. Применяется для выравнивания набора последовательностей, построения дерева из последовательностей или выравнивания, а также для контроля качества филогенетических деревьев, мультигенной филогеномики, анализа эволюционных скоростей и исследований сравнительной геномики.

mims-harvard official Данные

Что делает навык

Филогенетический анализ — de novo множественное выравнивание последовательностей (Clustal Omega/MUSCLE/MAFFT через EBI_msa_align) и построение деревьев методом соседнего соединения/UPGMA (EBI_build_phylogenetic_tree) на основе ваших собственных последовательностей, а также анализ деревьев, оценка древовидности, насыщения (PhyKIT), информативных для парсимонии сайтов, анализ пробелов в выравнивании, DVMC, обнаружение длинных ветвей, ортологи BUSCO. Использует PhyKIT, Biopython, DendroPy. Применяется для выравнивания набора последовательностей, построения дерева из последовательностей или выравнивания, а также для контроля качества филогенетических деревьев, мультигенной филогеномики, анализа эволюционных скоростей и исследований сравнительной геномики.

Как подключить

1Скачать навык
# возьмите папку навыка «tooluniverse-phylogenetics» из репозитория: # https://github.com/mims-harvard/tooluniverse
2Положить папку с SKILL.md к навыкам ассистента
# положите папку навыка туда, где ассистент ищет skills: cp -r tooluniverse-phylogenetics/ ~/.claude/skills/tooluniverse-phylogenetics/

Навык — папка с файлом SKILL.md (описание + инструкции) и опциональными скриптами. Ассистент (Claude, Claude Code и совместимые) подхватывает его по описанию и следует шагам.